中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所生物標本館是在50年代新疆綜合科學(xué)考察的基礎(chǔ)上建立的，自1956年中國科學(xué)院新疆分院成立，即開始以新疆為代表的中國內(nèi)陸干旱區(qū)生物、土壤標本進行采集、館藏，迄今已有近50年的歷史，包括植物、動物、微生物、土壤、沙樣等多方面內(nèi)容，現(xiàn)已積累館藏各類標本約12萬號，館藏各類標本數(shù)量為：植物：約10萬余份；動物：約5200份；微生物：約2000份；土壤斷面(整段)標本140余號、盒裝(剖面)標本1000余號；母巖新生體、侵入體及其它土壤形成物和供測試、分析用標本若干；各類沙樣及巖石、化石、出土文物等標本近2000余號。成為我國西北地區(qū)館藏種類、數(shù)量最多的綜合性標本館之一，在國際、國內(nèi)均具有典型的區(qū)域代表性。在館藏的標本中，還有近千號模式標本和許多單型科、屬及少型科、屬標本；此外還包括特有物種、國家級重點保護珍稀瀕危物種近200種。先后發(fā)表有關(guān)專著33部，論文70多篇；有關(guān)成果獲獎40多項。
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幾十年來，館藏標本對有關(guān)志書、專著、論文的編寫，提供了豐富、詳實的依據(jù)，例如《中國植物志》、《中國藥典》、《中國稀有瀕危植物紅皮書》、《新疆植物名錄》、《新疆藥用植物志》、《新疆植物志》、《新疆沙漠植物志》、《中國土壤分類》、《荒漠堿土》、《新疆通志》等等，并為一大批國家和地方重大、重點科研項目、各類科學(xué)考察、新疆各自然保護區(qū)規(guī)劃和建設(shè)等，提供了科學(xué)咨詢和科學(xué)依據(jù)。
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1995年中國科學(xué)院考慮研究所的方向和任務(wù)，撥?？钪С纸ǔ尚吗^，但內(nèi)部未做任何裝修，多是大框架結(jié)構(gòu)，總面積4397.8m2(四層建筑)。 中國科學(xué)院實施知識創(chuàng)新工程試點對院屬標本館的建設(shè)給予了極大支持，中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所生物標本館在院撥專項經(jīng)費的支持下，通過改造裝修、增添儀器設(shè)備，標本館面貌大為改觀。
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隨著現(xiàn)代社會向信息化、數(shù)字化方向的邁進, 中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所生物標本館，充分利用中國科學(xué)院專項經(jīng)費的支持，正在加大力度開展館藏各類標本條碼化管理和信息數(shù)據(jù)錄入的工作。標本館管理的科學(xué)化、網(wǎng)絡(luò)化、數(shù)字化進程，將使中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所生物標本館的管理逐步達到國家先進水平的行列，它將有利于發(fā)揮該標本館在中國干旱區(qū)乃至中亞地區(qū)生物多樣性研究的功能，使標本館能更好地為科學(xué)研究和國家經(jīng)濟建設(shè)服務(wù)。
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標本館先后接待了美國、日本、加拿大、俄羅斯、泰國、巴基斯坦等十多個國家的外賓，還利用館藏標本與國內(nèi)科研單位與高校交換標本。并通過開放日活動，接待來訪參觀，累計數(shù)萬人次，為高等學(xué)校學(xué)生實習(xí)，中小學(xué)生科普教育提供了條件，宣傳了新疆的資源、環(huán)境，增進了“愛我中華、愛我新疆”，取得了重要社會效益。1998年以來，該標本館先后獲國家、新疆維吾爾自治區(qū)、烏魯木齊市科普教育基地和青少年科技教育基地命名，并被新疆維吾爾自治區(qū)黨委組織部確定為干部輪訓(xùn)教育點。
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